Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX2Q04743 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms