Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPCQ03188 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms