Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MS4A2Q01362 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms