Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HSF1Q00613 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms