Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA4Q00056 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms