Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRB1P82279 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRB1P82279 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRB1P82279 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRB1P82279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms