Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCL20P78556 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL20P78556 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCL20P78556 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCL20P78556 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CCL20P78556 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL20P78556 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL20P78556 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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