Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB1AP62820 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms