Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RHOBP62745 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RHOBP62745 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RHOBP62745 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms