Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARF6P62330 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARF6P62330 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms