Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms