Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms