Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NME5P56597 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NME5P56597 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NME5P56597 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NME5P56597 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NME5P56597 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NME5P56597 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms