Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAD23AP54725 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms