Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOSBP53539 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOSBP53539 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOSBP53539 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOSBP53539 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms