Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEK4P51957 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms