Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms