Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLK1P49759 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLK1P49759 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms