Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTDSS1P48651 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms