Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MLH1P40692 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MLH1P40692 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MLH1P40692 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms