Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP6P35125 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP6P35125 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP6P35125 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP6P35125 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP6P35125 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP6P35125 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP6P35125 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP6P35125 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms