Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms