Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms