Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXA13P31271 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA13P31271 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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