Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL12P30050 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL12P30050 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL12P30050 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms