Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MARCKSP29966 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MARCKSP29966 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms