Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRNP28799 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRNP28799 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRNP28799 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRNP28799 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRNP28799 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms