Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXP28300 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LOXP28300 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LOXP28300 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LOXP28300 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXP28300 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXP28300 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms