Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTFRP26992 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNTFRP26992 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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