Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HMGB2P26583 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGB2P26583 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms