Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRR1P24046 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms