Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPHA1P21709 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms