Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMB1P20618 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms