Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACADSP16219 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSP16219 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSP16219 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSP16219 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACADSP16219 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSP16219 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms