Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF2F2P13984 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF2F2P13984 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms