Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYL1P12980 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms