Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms