Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3P10147 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL3P10147 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL3P10147 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL3P10147 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL3P10147 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL3P10147 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL3P10147 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms