Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VSIG8P0DPA2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms