Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47B1P0C2W7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CT47B1P0C2W7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms