Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPBP07199 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPBP07199 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPBP07199 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPBP07199 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms