Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LDHBP07195 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LDHBP07195 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LDHBP07195 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LDHBP07195 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDHBP07195 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDHBP07195 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LDHBP07195 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LDHBP07195 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms