Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITGB3P05106 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms