Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIX3O95343 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIX3O95343 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms