Protein–RNA interactions for Protein: O95167

NDUFA3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA3O95167 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NDUFA3O95167 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFA3O95167 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFA3O95167 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA3O95167 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms