Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP19O94966 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP19O94966 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP19O94966 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP19O94966 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP19O94966 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP19O94966 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP19O94966 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP19O94966 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP19O94966 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms