Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC45O75419 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC45O75419 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms