Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSVO60911 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSVO60911 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSVO60911 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSVO60911 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTSVO60911 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTSVO60911 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSVO60911 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTSVO60911 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms