Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIN3BO60391 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN3BO60391 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms