Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms